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orimabs技術(shù)領(lǐng)域

更新時(shí)間:2019-11-13點(diǎn)擊次數(shù):2255

 

orimabs技術(shù)領(lǐng)域

 

抗原制備

  • 重組蛋白制備
  • 抗原高表達(dá)細(xì)胞系的建立

抗體庫

  • 酵母菌展示
  • 噬菌體展示
  • 酵母展示人類天真的調(diào)光器-scFv庫
  • 酵母展示人類天真單體-scFv庫
  • 酵母展示人類天真的單域庫
  • 噬菌體展示人類天然Fab庫

抗體發(fā)現(xiàn)

  • 酵母展示庫平移
  • 噬菌體展示庫平移

抗體工程

  • 不同抗體形式之間的抗體轉(zhuǎn)化
  • 使用酵母展示進(jìn)行親和力成熟

抗體生產(chǎn)

  • scFv和Fab的大腸桿菌表達(dá)
  • scFv的酵母表達(dá)
  • scFv,F(xiàn)ab,scFv-Fc和全抗體的哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)

抗體應(yīng)用

  • 抗體藥物偶聯(lián)物
  • 雙特異性抗體
  • 光學(xué)成像的抗體標(biāo)記
 

重組蛋白制備
 

為了產(chǎn)生抗體,步是制備重組抗原蛋白。我們擁有用于重組蛋白表達(dá)的三個(gè)表達(dá)平臺(tái),包括哺乳動(dòng)物細(xì)胞(CHO和HEK293無血清系統(tǒng)),酵母和大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)。

對于人類抗原,哺乳動(dòng)物表達(dá)系統(tǒng)是理想的表達(dá)系統(tǒng),因?yàn)槠渲卣郫B和翻譯后修飾(例如糖基化)接近天然抗原。在大多數(shù)情況下,細(xì)胞表面抗原的細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域(例如腫瘤標(biāo)志物)是抗體生成的目標(biāo)域。需要制備細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域的重組蛋白,而不是完整的表面蛋白(包括單個(gè)或多個(gè)跨膜和細(xì)胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域)。然而,部分地由于其天然易位方式的改變而僅表達(dá)天然蛋白的一部分是非常具有挑戰(zhàn)性的。為了克服這個(gè)問題,我們開發(fā)了幾種新穎的哺乳動(dòng)物表達(dá)載體,它們能夠使這種困難表達(dá)蛋白高水平表達(dá)。
 

抗原高表達(dá)細(xì)胞系的建立
 

有時(shí)為了確保用于文庫篩選的抗原處于其天然構(gòu)象,我們使用抗原陰性和陽性細(xì)胞系來篩選文庫。我們有一個(gè)慢病毒表達(dá)系統(tǒng)來創(chuàng)建抗原高表達(dá)細(xì)胞系。抗原的高表達(dá)與細(xì)胞內(nèi)EGFP的表達(dá)有關(guān),因此可以通過熒光激活細(xì)胞分選術(shù)(FACS)純化高表達(dá)的細(xì)胞。

酵母菌展示

酵母展示是一種用于抗體發(fā)現(xiàn)的新開發(fā)技術(shù)。與噬菌體展示相比,酵母展示具有以下優(yōu)勢:真核表達(dá),利用FACS分選來選擇性分離不同親和水平群體的能力以及方便地通過FACS檢測抗原結(jié)合,這使得酵母展示成為發(fā)現(xiàn)新抗體的有力工具。

然而,很大程度上由于酵母轉(zhuǎn)化效率低而構(gòu)建大的酵母展示抗體文庫是非常具有挑戰(zhàn)性的。我們開發(fā)了一種技術(shù),可使酵母轉(zhuǎn)化效率比傳統(tǒng)方法提高1000倍,從而有可能有效地構(gòu)建大型酵母展示抗體庫。

除了優(yōu)化酵母轉(zhuǎn)化效率外,我們還開發(fā)了新穎的酵母展示載體,可以在單體或二聚體中展示scFv,具有*的標(biāo)簽和接頭,可有效克隆,展示,檢測和保護(hù)scFv的結(jié)構(gòu)和功能不受影響由共表達(dá)的AGA2蛋白和標(biāo)簽組成(圖1)。 

如果將分離的scFv的終目標(biāo)工程化為二聚體,例如scFv-Fv或完整抗體,則建議使用二聚體scFv庫,因?yàn)楦哂H和力單體scFv可能不會(huì)轉(zhuǎn)化為高親和力的二聚體。如果scFv是終的抗體形式,例如標(biāo)記納米顆粒或開發(fā)基于scFv的成像探針,則建議將單體scFv顯示庫用于scFv分離。有時(shí)抗原只有很小的口袋抗原決定簇,這很可能在小肽抗原中觀察到,全尺寸的scFv太大而無法適合小的口袋抗原決定簇,一個(gè)僅包含VH或VL的單結(jié)構(gòu)域文庫將是理想的屏幕。

我們還開發(fā)了一種使用重組蛋白,標(biāo)簽融合蛋白或基于細(xì)胞的篩選的綜合文庫篩選策略(圖1)。從文庫分離的scFv親和力通常在單體的納摩爾范圍內(nèi),并且當(dāng)被工程化以進(jìn)行調(diào)光時(shí),例如scFv-Fc或完整抗體,親和力通常將增加約10倍。
 

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插圖1:酵母顯示的二聚體和單體scFv。

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圖1:基于細(xì)胞的酵母展示抗體文庫淘選。

噬菌體展示

酵母展示對于Fab文庫的構(gòu)建是具有挑戰(zhàn)性的,因?yàn)楹茈y以適當(dāng)?shù)谋嚷释瑫r(shí)表達(dá)VH和VL / VK兩者以使VH和VL / VK之間100%偶聯(lián)。因此,我們的Fab文庫是使用噬菌體展示構(gòu)建的。OriMAbs已開發(fā)出用于Fab庫構(gòu)建的噬菌體展示系統(tǒng)。兩組噬菌粒,pDCK1和pDCK1.1;以及pDCL1和pDCL1.1分別設(shè)計(jì)用于κ和λ鏈Fab展示。兩種載體均具有IgG1 CH1恒定區(qū),并且所有恒定區(qū)均已針對大腸桿菌進(jìn)行了密碼子優(yōu)化。表達(dá)和所有酶被設(shè)計(jì)為方便消化和有效克隆。噬菌粒pDCK1和pDCL1也可以用于scFv展示,其中,接頭中的酶位點(diǎn)也被優(yōu)化以確保翻譯的接頭對于VH和VL之間的有效偶聯(lián)是靈活的。

酵母展示人類天真的調(diào)光器-scFv庫

使用*的技術(shù)和新穎的展示載體pYDS2(展示調(diào)節(jié)劑scFvs),OriMAbs從B淋巴細(xì)胞中分離出了1x1011酵母展示調(diào)節(jié)劑scFv庫,該B淋巴細(xì)胞來自于56例健康供體的5升外周血??偣卜蛛x出6.9 mg總RNA,并從中純化了125.3 mg mRNA,并使用能夠挽救所有人類抗體庫的新型引物用于逆轉(zhuǎn)錄和VH,VK和VL擴(kuò)增。ScFv在釀酒酵母上以較暗的方式顯示EBY100通過AGA1和AGA2之間的相互作用使細(xì)胞表面應(yīng)變。在測序的24個(gè)克隆中,所有克隆均包含scFv基因,其中83.3%具有單個(gè)scFv基因,16.7%具有2個(gè)scFv基因。Flag標(biāo)簽在100%克隆中表達(dá),而V5標(biāo)簽在83.3%(20/24)克隆中表達(dá)(圖2)。V5標(biāo)簽表達(dá)失敗是由于scFv基因發(fā)生移碼突變,可能是種系中編碼截短抗體或PCR引入的真實(shí)序列(3/24)或構(gòu)象障礙(1/24)。通過磁選和流選與該文庫隔離(圖3)。建議將該庫用于scFv發(fā)現(xiàn),以便將scFv工程化為二聚體,例如scFv-Fc或完整抗體。
 

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圖2:在24個(gè)酵母克隆中的V5表達(dá)顯示了人類天然的scFv文庫。紅色:陰性對照;藍(lán)色:V5標(biāo)簽表達(dá)

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圖3:在24個(gè)酵母克隆中的標(biāo)志表達(dá)顯示了人類天然的scFv文庫。紅色:陰性對照;藍(lán)色:標(biāo)志標(biāo)記表達(dá)

酵母展示人類天真單體-scFv庫

還使用不同的酵母展示載體pYDS1和相同的VH,VK和VL基因構(gòu)建了酵母展示的人類天然單體scFv庫,用于二聚體-scFv庫的構(gòu)建。庫大小為1.2×10 ^ 11。建議將該庫用于scFv發(fā)現(xiàn),因?yàn)閟cFv將是應(yīng)用程序的終格式。

酵母展示人類天真的單域庫

還使用酵母展示載體pYDS1和相同的VH,VK和VL基因構(gòu)建了酵母展示人類樸素單域文庫,用于單體或二聚體-scFv文庫的構(gòu)建。庫大小為5×10 ^ 9。推薦該文庫用于發(fā)現(xiàn)只有小口袋表位的抗原的單域抗體。
 

噬菌體展示人類天然Fab庫

我們使用分離自56個(gè)健康供體的相同5 L外周血的VH和VL池,使用載體pDCK和pDCL(kappa:lambda = 2:1)構(gòu)建了2×1010 Fab噬菌體展示文庫。評(píng)估的12個(gè)克隆顯示100%VK / VL插入和91.6%(11/12)VH插入。
 

從酵母展示文庫中發(fā)現(xiàn)抗體

我們還開發(fā)了一種使用重組蛋白,標(biāo)簽融合蛋白或基于細(xì)胞的篩選的綜合文庫篩選策略(圖1)。庫平移包括2-3輪磁選,然后是2-3輪精細(xì)流選。排序的高親和力酵母展示群體可直接使用流式細(xì)胞儀進(jìn)行個(gè)體克隆鑒定,或轉(zhuǎn)化為分泌型scFv亞庫,并使用高通量ELISA進(jìn)行個(gè)體克隆鑒定。鑒定出的scFv將被表達(dá)和純化以用于表征,例如親和力測量和插入分析,然后進(jìn)入下游工程流程。從文庫中分離出的scFv親和力在單體中通常處于納摩爾范圍內(nèi)(圖4),通常在經(jīng)過調(diào)光后,親和力會(huì)增加約10倍,
 

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圖4:樣品scFvs a和b的親和力測量。

通過噬菌體庫淘選抗體

我們已經(jīng)開發(fā)了固相和液相的噬菌體展示文庫淘選。直接在固相(例如ELISA板或免疫管)上的抗原包被可能會(huì)使抗原構(gòu)象變形,結(jié)果可能丟失一些表位,從而降低分離的抗體的多樣性,或者分離的抗體可能根本不結(jié)合天然構(gòu)象抗原。為了克服這個(gè)潛在的問題,我們已經(jīng)開發(fā)液相淘選法,其中,無論是抗原和抗體在其天然構(gòu)象。抗原結(jié)合的噬菌體群體將通過磁選分離,分離的可溶性Fab抗體將在大腸桿菌中產(chǎn)生。
 

抗體工程

從抗體庫中分離的單結(jié)構(gòu)域抗體,scFv或Fab抗體通常需要進(jìn)行工程改造以用于不同的目的,例如,可以將它們改造為scFv-Fc或全抗體,以實(shí)現(xiàn)更高的親和力,更好的穩(wěn)定性和更長的循環(huán)時(shí)間。我們提供所有已知格式的抗體的設(shè)計(jì)和工程改造,例如scFv,二聚體scFv,F(xiàn)ab,F(xiàn)(ab')2,單結(jié)構(gòu)域抗體,scFv-Fc和全抗體。

親和力成熟

通常,從我們的文庫中分離出的抗體具有納摩爾范圍的親和力,當(dāng)工程化為二聚體時(shí),親和力將增加約10倍。因此,從我們的文庫生成的抗體通常不需要親和力成熟。如果需要更高的親和力,我們可以選擇通過酵母和噬菌體展示技術(shù)進(jìn)行親和力成熟。

酵母展示的優(yōu)勢在于,可以使用熒光輔助細(xì)胞分選術(shù)(FACS)輕松對抗原結(jié)合的酵母菌群進(jìn)行分選,因?yàn)榻湍妇拇笮∽阋员籉ACS識(shí)別。這使酵母菌的展示比噬菌體在親和力成熟方面更有效,因?yàn)槌擞糜谑删w展示的抗原濃度管理和嚴(yán)格洗滌之外,F(xiàn)ACS在直接將高親和力酵母種群從其他培養(yǎng)基轉(zhuǎn)化為高親和力酵母菌方面更有效(圖xx) 。

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圖5:用于抗原結(jié)合的高親和力酵母群體的流式分選。

抗體生產(chǎn)

我們已經(jīng)開發(fā)了用于抗體表達(dá)的表達(dá)系統(tǒng),包括用于以細(xì)胞內(nèi)或分泌形式表達(dá)單結(jié)構(gòu)域抗體,scFv和Fab的大腸桿菌系統(tǒng);用于單結(jié)構(gòu)域抗體,scFv和Fab分泌表達(dá)的酵母系統(tǒng); 和用于所有片段抗體和全抗體的分泌表達(dá)的哺乳動(dòng)物系統(tǒng)。我們提供通過這些表達(dá)系統(tǒng)生產(chǎn)和純化所有抗體形式的服務(wù)。
 

抗體藥物偶聯(lián)物

抗體藥物偶聯(lián)物(ADC)是一種新興的抗體治療技術(shù)??贵w(通常是全抗體)通過可裂解或不可裂解的連接子用超毒性藥物(例如MMAE,MMAF和DM1)標(biāo)記,以特異性地向抗原陽性細(xì)胞傳遞毒性。死細(xì)胞釋放的毒素(MMAE和DM1)也可以通過旁通機(jī)制進(jìn)入并殺死附近的抗原陽性細(xì)胞。我們提供與這些藥物結(jié)合的完整抗體和相關(guān)特性的服務(wù)。 
 

雙特異性抗體

雙特異性抗體(一個(gè)臂使用抗CD3抗體靶向T細(xì)胞,另一臂使用腫瘤特異性抗體靶向腫瘤細(xì)胞)充當(dāng)將T細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞結(jié)合在一起并激活T細(xì)胞殺死腫瘤的橋梁。我們提供設(shè)計(jì),構(gòu)建,表達(dá)和評(píng)估雙特異性抗體的服務(wù)。

光學(xué)成像的抗體標(biāo)記

光學(xué)成像是一種用于體內(nèi)抗體生物分布研究的方便且有用的方法,例如小鼠中的抗原表達(dá)譜研究,小鼠模型中的腫瘤靶向評(píng)估。由于近紅外(NIR)染料在組織中的深度滲透(大約1 cm),因此常用于這些研究。我們提供與這些染料和相關(guān)表征有效結(jié)合和純化片段抗體或完整抗體的服務(wù)。

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